RNA各種可逆的化學修飾被認為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細胞(HCC)和多種實體中高表達。在臨床上,METTL3的過度表達與肝細胞患者不良預有關(guān)。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達METTL3會促進HCC細胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達從而促進HCC進展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達。動物疾病模型是一種用于研究人類疾病的重要工具。湖北豚鼠科研技術(shù)服務分離

一種是用beta巰基乙醇打開蛋白質(zhì)分子二硫鍵的,另一種是用DTT(二硫蘇糖醇)。兩者的作用是一樣的,但特點不一樣,前者更容易與氧氣反應,穩(wěn)定性比后者差,如果在常溫下暴露在空中,前者只能維持24小時的活性,后者卻可以維持7天左右。所以該如何選擇?如果是蛋白樣品較少,跑幾次就可以用完的樣品,這時選擇beta巰基乙醇。如果樣品很多,計劃跑上幾十次的,優(yōu)先選擇DTT,建議變性后分裝保存。二、SDS-PAGE凝膠配制1、配膠前準備首先強調(diào)一下,一塊好的膠是跑好蛋白的前提,所以這個環(huán)節(jié)也不容忽視。玻璃板的選擇,一種是1毫米厚度的,另一種是,這個厚度選擇也是有講究的,如果上樣體積小于10微升,優(yōu)先選1毫米,否則選。原因是什么?答案在轉(zhuǎn)膜部分揭曉。還有分離膠的濃度也要選擇適合的。然后玻璃板和梳子要洗干凈,晾干。裝板,注意厚板和薄板的底部要對齊,否則會漏膠。加制膠的各成分前,要觀察液體是否有沉淀,有沉淀的盡量不要用。2、制膠按配方說明依次加入各組分,加完SDS后先簡單手動搖勻幾下,然后迅速加入過硫酸銨和TEMED,搖勻,緊接著就灌膠。然后我習慣用95%的酒精壓膠,我也用過純水,感覺純水壓沒那么好,由于水的密度較大,會把分界處的膠壓得膨大。疾病科研技術(shù)服務服務上海研錄生物醫(yī)藥為您提供一站式科研技術(shù)服務。

METTL3能夠促進肺腺細胞的生長、生存和侵襲,但還不清楚它是否作為m6A調(diào)節(jié)器或效應器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細胞白血病(AML)患者中,m(6)A調(diào)控基因的突變或拷貝數(shù)變化與TP53突變存在密切聯(lián)系,且m(6)A調(diào)控基因的改變與AML不良預相關(guān)[26]。此外,F(xiàn)TO在AML中高表達,它通過降低mRNA轉(zhuǎn)錄本中的m(6)水平,調(diào)節(jié)ASB2和RARA等靶點的表達,增強了白血病基因介導的細胞轉(zhuǎn)化和白血病形成,并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導的AML細胞分化[27]。在脂肪形成過程中,F(xiàn)TO表達與m6A水平成負相關(guān),促進脂肪形成[3]。在膠質(zhì)細胞瘤樣細胞中,ALKBH5通過lncRNAFOXM1介導FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質(zhì)瘤細胞的成瘤性[28]。此外,甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3或METTL14的敲除,能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達,極大地促進了膠質(zhì)瘤細胞的生長、自我更新和形成[29]。圖2m6ARNA修飾和介導的功能[30]m6A的研究方向主要是通過研究m6A修飾相關(guān)的甲基化、去甲基化酶和識別蛋白的功能,進而研究m6A修飾的生物學功能和作用機制:一般通過敲除m6A酶分子,研究下游功能基因分子的表達和m6A甲基化情況,通過介導相關(guān)基因異常(可變剪切、穩(wěn)定性、翻譯、miRNA調(diào)控)影響細胞表型和功能特征。
原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個質(zhì)粒:質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒,其同時含有目的基因和報告基因,psPAX2是可以表達慢病毒外殼的質(zhì)粒,其表達產(chǎn)物可通過粘附機制更易穿過細胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒,通過脂質(zhì)體進行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細胞基因組中,宿主基因組在表達時,隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進入細胞后,其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA,該基因再整合到靶細胞的基因組中,完成轉(zhuǎn)染過程。因為質(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達目的基因卻不能表達出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細胞能反復增殖,故對宿主細胞是無害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生,包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS,對數(shù)期293T細胞,細胞計數(shù)器,病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細胞鋪板取對數(shù)生長期的293T細胞,用的胰蛋白酶消化293T細胞,計數(shù)。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細胞均勻鋪入。若是6孔板。可以幫助科研人員深入理解疾病的共同性,即不同物種之間存在的共有病理變化過程。

m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態(tài)發(fā)布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。建立疾病模型的目的是為了防治人類疾病。湖南血液科研技術(shù)服務技術(shù)
EdU細胞增殖檢測是一種新型的細胞增殖檢測方法。湖北豚鼠科研技術(shù)服務分離
在人類疾病研究中數(shù)據(jù)表明,常用實驗動物模型按產(chǎn)生原因分為以下5類:自發(fā)性動物模型、誘發(fā)型動物模型、遺傳工程動物模型、生物醫(yī)學動物模型和陰性動物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧:1、自發(fā)性動物模型:是指動物未經(jīng)任何有意識的人工處理,在自然條件下或基因突變條件下所產(chǎn)生的疾病模型。主要包括突變型的遺傳病模型和近郊系的疾病模型。2、誘發(fā)型動物模型:亦稱實驗性動物模型。是使用物理、化學或生物致病因素誘導動物產(chǎn)生某些類似人類疾病表現(xiàn)而制備的動物模型。此模型具有制備方法簡單,實驗條件容易控制,重復性好等特點,廣泛應用于藥物篩選、毒理、傳染病、病理機制的研究。3、遺傳工程動物模型:是利用遺傳工程技術(shù)對動物基因組進行修飾,用于研究基因功能或疾病機制的動物模型。也稱基因修飾動物模型,是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術(shù)有目的的干預動物的遺傳組成,導致動物出現(xiàn)新的性狀,并使其能夠有效地遺傳下去,形成新的可供生命科學研究的和其他目的所用的動物模型。4、生物醫(yī)學動物模型:也是指利用健康生物的特定生物學特征,研究人類疾病相似表現(xiàn)得模型。這類動物模型與人類疾病存在一定的差異,研究者應加以比較,從中獲得有關(guān)材料。湖北豚鼠科研技術(shù)服務分離