m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態發布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。EdU細胞增殖檢測是一種快速、準確、靈敏的細胞增殖檢測方法.江蘇動物科研技術服務培養

1.首要原則：細胞不重要情況下立即丟棄，培養箱滅菌，所用培養基也都要丟棄，器械等重新滅菌或拆用新的。2.細菌污染一般都救不回來了，發現的時候培養基一般都很渾濁且細胞都死了3.污染且細胞很重要時：遇到念球菌污染，且細胞為基因改造細胞，非常重要。如231貼壁乳腺細胞，發現細胞周圍出現很小的串珠透亮圓點，非常像念球菌污染，此時細胞狀態尚可，且污染少。處理如下：用預熱或室溫PBS清洗3次，可適當振搖，將污染沖洗下來。隨后加入10-20%雙抗到培養瓶，置于37度培養箱1h，之后再用PBS清洗三遍，直至視野下無可見污染。此時細胞也被沖下大部分，因此此方法只適用在細胞貼壁強，狀態好，密度高時使用。之后每天再更換培養基，每次用PBS沖洗2遍。過幾天細胞狀態尚可時，消化離心時用500r，3min，去掉上清，重復3次。這個方法是根據文獻可利用念球菌和細胞體積重量差異實現分離。基本上這一步做完以后，污染就基本了，接下來就注意多觀察，勤換液就行。湖南大鼠科研技術服務構建科研技術服務的價值在于將科研成果轉化為實際應用，推動社會進步與發展。

在人類疾病研究中數據表明，常用實驗動物模型按產生原因分為以下5類：自發性動物模型、誘發型動物模型、遺傳工程動物模型、生物醫學動物模型和陰性動物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧：1、自發性動物模型：是指動物未經任何有意識的人工處理，在自然條件下或基因突變條件下所產生的疾病模型。主要包括突變型的遺傳病模型和近郊系的疾病模型。2、誘發型動物模型：亦稱實驗性動物模型。是使用物理、化學或生物致病因素誘導動物產生某些類似人類疾病表現而制備的動物模型。此模型具有制備方法簡單，實驗條件容易控制，重復性好等特點，廣泛應用于藥物篩選、毒理、傳染病、病理機制的研究。3、遺傳工程動物模型：是利用遺傳工程技術對動物基因組進行修飾，用于研究基因功能或疾病機制的動物模型。也稱基因修飾動物模型，是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術有目的的干預動物的遺傳組成，導致動物出現新的性狀，并使其能夠有效地遺傳下去，形成新的可供生命科學研究的和其他目的所用的動物模型。4、生物醫學動物模型：也是指利用健康生物的特定生物學特征，研究人類疾病相似表現得模型。這類動物模型與人類疾病存在一定的差異，研究者應加以比較，從中獲得有關材料。

m6A修飾圖譜構建及作用機制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq,miCLIP）構建疾病細胞模型或者發病組織的m6A修飾譜，分析m6A的motif,peaks數量及分布，Peak關聯基因的特征，聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制，作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1，通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節，作者研究了FOXM1的鄰近基因，發現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補，且共表達、共定位，進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖，從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發生。傳統的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化，組蛋白修飾和染色質重構。近。純干貨Western blot （WB）條帶灰度統計與GraphPad作圖.

用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選（細胞水平的結合和阻斷）、CAR分子的殺傷活性評價。材料與儀器（以慢pMSCV載體為例）包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質粒、GAG質粒、VSV質粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構建1)根據目的基因mRNA編碼區設計引物，分別在引物兩端加入酶切位點EcoRI和BglII。2)從細胞中提取目的基因mRNA，然后逆轉錄成cDNA，然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區擴增出來。PCR擴增出帶有酶切位點的目的基因編碼區序列，連接至pMD19-T載體后轉化至感受態DH5α，分別進行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列，電泳割膠回收純化，連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉化到感受態DH5α，菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后，送至公司測序、鑒定。4)鑒定成功后，將質粒轉化至感受態DH5α中，并進行無內質粒抽提。GAG質粒和VSV質粒同樣可以轉化至感受態DH5α中，并進行無內質粒抽提。質粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養基培養6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。動物疾病模型還為科研人員提供了研究人類疾病的跨學科方法。天津科研技術服務分離

科研技術服務不僅提升了科研項目的成功率，也促進了科研人才的培養與發展。江蘇動物科研技術服務培養

把膜先用TBST泡洗兩遍再用5%脫脂奶粉或者BSA室溫封閉1-2小時。注意一定要讓蛋白面充分接觸封閉液。2、孵一抗脫脂奶粉封閉的話，要用TBST泡洗三遍再轉移至一抗溶液中，BSA封閉的可以直接轉移至一抗中。如果膜的寬(膜是一個長方形，這里的寬與長相對應)不大于8毫米，我習慣置于15毫升離心管中孵育，兩條膜"背對背"式放置于一個管子里(3毫升液體即可)。如果大于8毫米，就用普通的5格的一抗孵育盒(4毫升即可)。4度過夜，一般是12-18個小時，注意放置水平，用搖床。內參等蛋白豐度很高的如果孵久了可能出現條帶連在一起的情況，這時可以縮短孵育時間或者降低一抗的濃度。六、孵二抗顯影1、孵二抗室溫一個小時足矣。這步要注意的是建議用5%BSA或者脫脂奶粉稀釋二抗，這樣背景會干凈許多。也要注意膜的蛋白面要充分接觸二抗溶液，我們一般一條膜一個槽地孵。2、顯影這一步有個細節可能有些同學沒注意到，就是ECL發光液要與HRP反應一分鐘后顯影效果才會更好，還有要注意的是顯影液要均勻覆蓋，一般第二次顯影(加新的顯影液)比一次好看。江蘇動物科研技術服務培養