m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態發布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。干貨分享 | 避坑，微生物培養的污染因素及預防方法，少走彎路。廣西兔科研技術服務購買

動物模型在科研中有著普遍的應用。首先，它們可以幫助科研人員深入理解的共同性，即不同物種之間存在的共有理變化過程。通過對動物模型的研究，科研人員可以更清楚地了解的發展過程和機制，為人類的檢查提供理論依據。其次，動物模型還為新研發和苗測試提供了的平臺。在研發過程中，科研人員可以通過對動物模型進行處理，觀察其和副作用，為新的臨床試驗提供依據。而在苗測試中，動物模型則可以用來評估苗的性和安全性。此外，動物模型還為科研人員提供了研究人類的跨學科方法。例如，通過比較人類和動物模型的基因組學、蛋白質組學等數據，可以發現與發生相關的關鍵基因和蛋白質，從而為的和檢查提供新的思路。雖然動物模型在科研中發揮了巨大的作用，但也存在一些挑戰。首先，由于物種差異的存在，動物模型的表現與人類可能存在差異，因此需要謹慎使用。此外，動物模型的倫理問題也不容忽視，科研人員需要在符合倫理規定的前提下進行相關研究。盡管存在挑戰，動物模型的發展前景仍然值得期待。隨著科技的不斷進步，科研人員將能夠開發出更為精確、實用的動物模型。廣西小鼠科研技術服務構建干貨分享 | 瓊脂糖核酸電泳，選擇紫外還是藍光？

靜置25分鐘后把酒精倒干，用吸水紙吸出多余的酒精，然后配壓縮膠，同樣的操作，關鍵是梳子要插得快，要小心梳子下產生氣泡，然后靜置30分鐘。如果是當天跑膠，我會等上層膠凝2個小時再用，但要注意防干燥縮水，可以在一個小時的時候沿著梳子上緣加點電泳液。所以我一般提前一晚制膠，泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準備把膠組裝到電泳芯上，注意密閉性(否則漏液)，如果內槽漏液就不是勻強電場了，條帶可能就不是一條直線。然后內槽倒滿電泳液，拔梳子，這一步要小心，梳子要兩邊一起緩緩往上拔出，然后觀察泳道內有無脫落的膠粒或者膠絲，有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品，解凍。準備振蕩器。2、上樣和電泳注意，上樣后蛋白會開始慢慢在膠中彌散，所以上樣越快越好。我習慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品，蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩)，吸的時候沒有拉絲即可，建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來，不然樣品中SDS可能會結晶析出，從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘，下層膠120V65分鐘。四、轉膜1、轉膜前準備我會在電泳結束0分鐘準備，把轉膜液配好置于4度冰箱預冷，然后裁膜，準備轉膜裝置。

圖2MAZTER-Seq實驗流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下，檢測到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠，那檢測的特異性位點是否準確呢？作者也將該方法檢測到的新甲基化位點使用放射標記層析檢測，發現預測的位點準確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中，作者則是與m6A抗體IP的方法進行了比較，也證實了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結果驗證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外，后文中作者也在大規模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態和酵母減數分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統；并進一步通過這一方法檢測了哺乳動物不同細胞間m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術，其他部分暫不過多分析了。新的技術能拓展我們的研究內容；對于這一技術。科研技術服務致力于推動前沿科技的研究與發展，為企業提供定制化的技術解決方案。

RNA各種可逆的化學修飾被認為是一種新的表觀遺傳調控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學修飾，在調控mRNA穩定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉錄組測序發現了METTL3（甲基轉移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉移酶，在人肝細胞（HCC）和多種實體中高表達。在臨床上，METTL3的過度表達與肝細胞患者不良預有關。體外實驗證明敲除METTL3會抑制HCC細胞增殖，遷移及克隆形成。體內實驗證明敲除METTL3會明顯抑制HCC體內成瘤和肺轉移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統，內源性高表達METTL3會促進HCC細胞在體外和體內生長。通過轉錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR，作者確定了SOCS2（細胞因子信號2的抑制因子）作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之，METTL3在HCC大部分高表達中,并通過m6A-YTHDF2依賴機制抑制SOCS2表達從而促進HCC進展。因此，作者發現了在肝發生過程中表觀遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉移酶METLLT3在肝組織中高表達。生物分子學是研究生命體系中分子結構、功能和相互作用的學科。湖南疾病科研技術服務實驗

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這種細胞保持著其原始的生物學特性，具有高度的活性和分裂能力。原代細胞在許多生物醫學研究中具有重要地位，包括藥物篩選、疾病模型的建立以及疫苗研發等。原代細胞的獲得通常是通過組織剪切、消化或酶解等方式從機體或組織中分離出來。這些細胞脫離了它們在生物體中的環境，但是仍然保持著其基本的生物學特性，包括細胞膜、細胞核、細胞器以及其他重要的生物分子。原代細胞在未經過傳代培養的情況下，保持著其原始的生物學特性，因此，它們常常被用于藥物篩選、毒理學研究等。同時，由于原代細胞具有高度活性和分裂能力，它們也被用于組織工程和再生醫學中，如皮膚移植、骨頭修復和神經再生等。此外，原代細胞模型在疾病研究中也扮演著重要角色。由于原代細胞具有更高的生物真實性，使用它們建立的疾病模型能夠更準確地模擬疾病的發展過程和藥物的作用機制，從而為新藥研發和疾病治、療提供更有效的工具。總之，原代細胞是一種具有高度活性和分裂能力的細胞，在生物醫學研究中具有重要的作用。由于其原始的生物學特性。廣西兔科研技術服務購買