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海洋生物外泌體lncRNA測序

來源: 發布時間:2023-09-02

外泌體是指包含了復雜RNA和蛋白質的小膜泡(30-150nm),現今,其特指直徑在40-100nm的盤狀囊泡。多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體。其主要來源于細胞內溶酶體微粒內陷形成的多囊泡體,經多囊泡體外膜與細胞膜融合后釋放到胞外基質中。現在外泌體特指直徑在40-100nm的盤狀囊泡。多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體。其主要來源于細胞內內溶酶體微粒內陷形成的多囊泡體,經多囊泡體外膜與細胞膜融合后釋放到胞外基質中。外泌體與各種疾病的相關性被檢測出,特別是血液中釋放的病細胞來源的外泌體。海洋生物外泌體lncRNA測序

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外泌體中包含的mRNAs和miRNAs在進入受體細胞后仍具有翻譯蛋白質、促進病毒感ran等功能。據估計,單個外泌體含有約≤100拷貝數的蛋白質和≤10000拷貝數的核苷酸。不同細胞來源的外泌體中既包含與細胞形成、結構和物質轉運相關的共有成分,也包含與來源細胞的生物功能相關的特異分子。如B淋巴細胞、樹突狀細胞、肥大細胞和腸上皮細胞來源的外泌體含有大量的主要組織相容性復合體蛋白質MHCclassⅡ和MHCclassⅠ,血小板和T細胞來源的外泌體則包含諸如血管性血友病因子、穿孔素和顆粒酶等特殊蛋白質,而ai細胞來源的外泌體表面可能含有中流特異的蛋白質分子。這類特異分子在外泌體介導細胞信號轉導、參與生理病理過程中發揮至關重要的作用。海洋生物外泌體lncRNA測序細胞表面受體表達不同,外泌體對受體細胞的影響可能不同,可能誘導細胞存活,也可能誘導凋亡或免疫調節等。

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雖然外泌體在疾病的診斷上有天然優勢,但在臨床應用上仍有一些限制:外泌體的提取方法金標準仍然是差速離心法,但這種方法費時費力且提取效率較低,難以進行臨床推廣和應用;而商業化的試劑盒質量參差不齊,往往導致提取物雜質過多,且其售價較高。外泌體的定量是采用顆粒濃度定量,蛋白濃度定量,亦或是核酸濃度定量,目前仍存有爭議。由于傳統的內參并不適用于外泌體,在實時熒光定量PCR檢測靶分子含量時內參的選擇尚沒有統一的標準。外泌體分子標志物的研究還處于初級階段。目前外泌體研究的整個流程中成本都很高。

結果表明,PS親和法可以檢測到許多目前為止都無法檢測的外泌體蛋白質和RNA。應用Tim4的外泌體強結合能力,可用ELISA或FACS高靈敏度定性檢測、定量分析外泌體。以前無法用超速離心法提取的微囊泡,也通過運用PS親和法實現高純度提取。本指導書中對該技術進行詳細說明,這項技術的有用性今后將受到世界各方評價,有望在外泌體和微囊泡生理功能的分析研究上起重大貢獻。外泌體的檢測和提取還遇到一個困難即:對各種外泌體的分類。研究人員尚未統一定義以何種方法提取的細胞外囊泡可以稱之為外泌體,給實驗數據的分析和重復性確認帶來困難。近年,隨著國際細胞外囊泡協會的成立、世界性研究者研討會的舉辦,提案MISEV指南作為國際標準,計劃或已經開始進行EV研究的科學家請務必閱讀這些方針。有望在外泌體和微囊泡生理功能的分析研究上起重大貢獻。

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外泌體在神經系統中與神經回路的控制相關,同時各種神經退行性疾病的致病蛋白還可以通過外泌體釋放到細胞外并傳遞到其他細胞,與病情發展密切相關。病細胞釋放的外泌體含有許多與血管新生和免疫逃逸相關的分子,構建適合病細胞生長的微環境,促進病細胞的發展。另外,病細胞來源的外泌體上粘著分子的表達形式決定著癥狀向身體部位的轉移途徑。近,有報告指出脂肪細胞釋放的外泌體對肝臟的遺傳基因表達有控制作用。許多病毒利用外泌體的產生路徑傳播細胞,受病毒傳播的細菌和寄生蟲通過外泌體控制其他受細胞傳播的細菌、寄生蟲的活動。免疫印跡法(WB)和Elisa檢測法作為被普遍應用的外泌體檢測的一般方法。研究所外泌體提取試劑盒成分

確認外泌體生理作用的單獨方法就是明確外泌體的釋放機制,通過促進或壓制釋放機制。海洋生物外泌體lncRNA測序

尺寸排除色譜法是使用聚合物凝膠或類似的固定相柱進行外泌體分離的技術,樣品以重力滴落的方式收集。流體力學半徑較小的樣品組分進入凝膠孔隙后,需耗費相對較長的時間通過凝膠柱,導致延遲洗脫,實現不同粒徑大小顆粒分離。尺寸排除色譜法可以與差速離心法結合而不會明顯損失外泌體,保證產量的同時可有效去除雜質蛋白,更適合目標蛋白質組學和miRNA的分析。靜水過濾透析法主要利用靜水壓力迫使樣品中不同特定大小分子先后通過透析管,其中溶劑和小溶質很容易通過透析管,而較大的顆粒,如外泌體和其他囊泡,仍留在透析管中而被收集。海洋生物外泌體lncRNA測序

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